Miseq利用Illumina新一代测序技术可以高通量、并行对核酸片段进行深度测序，测序的技术原理是采用可逆性末端边合成边测序反应，首先在DN****段两端加上序列已知的通用接头构建文库，文库加载到测序芯片Flowcell上，文库两端的已知序列与Flowcell基底上的Oligo序列互补，每条文库片段都经过桥式PCR扩增形成一个簇，测序时采用边合成边测序反应，即在碱基延伸过程中，每个循环反应只能延伸一个正确互补的碱基，根据四种不同的荧光信号确认碱基种类，保证***终的核酸序列质量，经过多个循环后，完整读取核酸序列。

1、 可以在8小时内完成样品制备、测序和数据分析，用于快速鉴定；

2、 低样品用量（NexteraXT样品制备）:DNA样本需1ng；适于珍贵的临床样品

3、 可同时进行96个样品的1536重扩增产物的测序

4、 扩增、测序和数据分析在同一台仪器上完成

1）未知物种基因组测序（De Novo Sequencing）

2）已知物种的基因组重新测序（Resequencing）

3）多重扩增产物重测序（Multiple Amplicon Sequencing）

4）基因组/转录组分析（Transcriptomics）

5）基因表达谱及基因调控研究（Gene Expression）

6）全基因组小分子RNA（miRNA）分析

7）染色质免疫互沉淀研究（ChIP-Seq）

8）多重单核苷酸多型性分析（Multiplex SNP Genotyping）

9）甲基化研究（Methylation）

10）宏基因组学研究（Metagenomics）